В 1994 году была выпущена первая версия программы «Топ-Склад», предназначенная для работы в операционной системе DOS и включавшая в себя базовый набор функциональных возможностей, необходимых для организации мультискладского учёта. Уже через полгода было принято решение о переносе программы в среду Windows. На тот момент (начало 1995 года) это была одна из первых разработок такого рода, что привлекло к программе «Топ-Склад» внимание многих пользователей.

     Следующим важным этапом развития фирмы является создание в 1996 году версии программы с применением технологии «клиент-сервер». Новая версия обеспечила крупным фирмам возможность работать со своими филиалами в режиме реального времени в условиях интенсивной загрузки сети и с использованием сетей с низкой пропускной способностью, например, на основе модемного соединения.

     В 2001 году, исправно отслужив пользователям почти 5 лет, внешне практически не изменившись, система приобрела второе дыхание. Было полностью переработано ядро системы, на которое возложены функции хранения и обработки данных, обеспечения параллельной работы пользователей. В основу, как и прежде, легла технология «клиент-сервер», которая наилучшим образом обеспечивает многопользовательский режим работы. Однако в новой реализации на порядок повышена надёжность хранения данных, сняты ограничения по объёму хранимой информации. В прежних версиях программы для эффективной работы необходимо было не реже, чем 1 раз в 2 года проводить архивацию данных, при которой все совершённые сделки переносятся в архивное хранилище, а в системе остаются лишь справочники клиентов, товаров и складов и текущие остатки товаров на каждом из складов. Новый «Топ-Склад» позволяет хранить всю историю операций, обеспечивает простой доступ к любым данным и их быструю обработку. Кроме того, система стала значительно более гибкой и теперь позволяет подключать дополнительные модули, которые обеспечивают расширенную функциональность.